Auf der Playstation 3 erschien Splinter Cell: Conviction zwar nicht aber dennoch entschied Ubisoft sich dazu, die Story in Blacklist fast ohne Lücken fortzusetzen. Genauer gesagt ist Blacklist 6 Monate nach dem Ende von Conviction angesiedelt und konzentriert sich auf Sam Fisher.
Laut Creative Director Maxime Béland werden einige Storyinhalte nochmals aufgegriffen und einige Unklarheiten und Geheimnisse werden aufgedeckt.